国家一级的警察机关是国家警察安全委员会和警察厅。警察厅是由警察厅制定基本政策，警察厅负责管理警察事务的机构，因此警察厅是由警察厅控制的机构。
国家警察委员会是一个政府机构，主要负责对警察的行政监督和协调警察行政管理。该署亦监察与警察教育、通讯、刑事鉴定、刑事统计和警察装备有关的事宜。为了确保国家安全委员会的独立性和中立性，甚至连首相都无权指挥和命令国家安全委员会。国家警察安全委员会的任务是通过使警察部队不受政治压力的影响，并确保在警察行政中维持民主方法，从而保证警察的中立。该委员会的主要职能是监督警察厅，并有权任命或解雇高级警官。该委员会由一名国务大臣级别的主席和五名经国会两院同意由首相任命的成员组成。该委员会独立于内阁运作，但主席是内阁成员，促进了与该委员会的联络和协调。
日本警方是一个不涉及政治的机构，受独立机构的监督，不受中央政府的直接行政控制。他们受到独立的司法机构的检查，并受到自由和活跃的媒体的监督。警察一般都很受尊重，在工作中可以依靠公众的大力合作。参与刑事司法系统的官员通常是受过高度训练的专业人员，对预防犯罪和改造罪犯感兴趣。在处理违法行为时，他们被允许有相当大的自由裁量权，似乎值得公众对他们的信任和尊重。
公共秩序的状况比其他工业化国家要好。按照北美和西欧的标准，总体犯罪率较低，自20世纪60年代中期以来总体呈下降趋势。暴力犯罪的发生率特别低，部分原因是有效执行了严格的枪支管制法律。尤其值得关注的问题是那些与现代工业化国家有关的问题，包括青少年犯罪、交通管制和白领犯罪。
20世纪50年代初，国内动乱开始发生，主要发生在东京，但并没有严重威胁到国家的内部安全。在20世纪70年代初以后，这种情况已经不那么常见了，但在所有情况下，都被训练有素、效率高、使用最先进的防暴技术的警察部队有效地应对了。