一个小型情报机构，司法部的公安调查机构，负责处理国内和国外的国家安全事务。主要从事反间谍活动，其活动一般不为公众所知。Koancho成立于1952年，是一个调查和控制内部颠覆活动的机构。它有大约1800名调查人员。其活动主要集中在极左和极右，以及其早期的主要目标日本共产党。此外，该组织可能是日本境内对韩国居民实施监控的唯一组织。目前，该组织正将监控重点放在奥姆真理教(Aum Shinrikyo)身上，这在一定程度上是为了获得更多合法性。
《防止颠覆活动法》于1952年7月21日生效，同年，根据该法成立了公安侦查机关，是依法执行对颠覆组织进行调查、要求采取治理行动等综合性任务的执行机构。《防止颠覆活动法》的目的是采取必要的措施，控制其活动，甚至解散其组织，对从事暴力颠覆活动的个人给予适当的惩罚，保护日本人民的民主和基础，享受和平和有保障的生活。
公安侦查机关由内设机关、院、区、地办事处组成。内部部门有综合部、一调查部、二调查部，全国设有8个地区公安调查局和43个地级公安调查局。
公安调查机构旨在为确保公众保障的宗旨。在其关键任务中，将根据颠覆性活动预防法律进行调查，进入组织结构和组织的活动，这些组织通过暴力手段摧毁日本宪法所保证的民主制度，而在此活动中确定了结果调查符合法律的要求，有些控制措施包括解散，是公安调查机构的任务，向公安考试委员会转发控制措施请求。
对组织的控制是对无视宪法规定的基本法律和秩序、从事暴力颠覆活动的组织采取的一种行政措施，人们仍然担心该组织将来可能进行类似活动。对组织的控制包括对具体活动的限制和对组织的解散。
为了进行控制颠覆组织所需的调查，公安调查机构在全国各地设有公安调查人员。《防止颠覆活动法》赋予公安调查人员调查的权力。这项调查权力没有强制权力，如扣押证据或搜查房屋，但仅限于可选择的基础。
到20世纪90年代初，随着国内极左势力活动的逐渐消失，PSIA失去了主导地位。那就是奥姆最高真理导致东京毒气袭击的时候。PSIA事先没有关于AUM的档案和资料，急忙前去调查这个邪教，因此，在1995年冬天，设法做好了实施“颠覆活动预防法”的准备。PSIA在AUM相关问题上确立了权威地位。然而，由于证据不足，公安考试委员会最终拒绝了PSIA要求解散AUM的请求。
在1996年以来的行政改革中，日本政府决定缩减PSIA的规模，将一部分人员分配给其他机构，即内阁情报研究室和外务省。这些人员将被派往国外，以加强日本的海外情报活动。目前PSIA有1700 - 1800个成员，最终将减少到最多1100个。其他600-700名工作人员将被分配到这些其他机构。第二调查部负责外国情报工作。2-2分部与世界上30多个情报机构有联系，包括中央情报局、联邦调查局、军情六处、摩萨德等。美国中央情报局邀请PSIA官员到华盛顿特区参加情报分析课程的培训。一个名为“九段会”(Kyudankai)的“外部组织”负责分析有关苏联军事动向的信息(并开展间谍活动)。据报道，该组织知道1980年即将入侵阿富汗，并将这些怀疑转达给了日本政府。